Короткое видео о том как выбирать пороговое значение диагностического теста, при котором тест считается положительным или отрицательным. Видео на английском, но есть русские субтитры. Диагностика любого заболевания зависит не только от значения теста, но и от других обстоятельств (распространенности заболевания, медицинской значимости ложных результатов и т.д.) – о чем рассказано в данном ролике.Один из примеров демонстрирует особенности диагностического теста на наличие Ковид-инфекции.

Если вы хотите увидеть дальнейшие материалы о диагностических тестах – пишите комментарии на страничке ролика в Ютюбе.

Читать дальше »

Наряду с коммерческими статистическими пакетами существует довольно большое число полностью бесплатных статистических программ и приложений. При этом ряд бесплатных программ не только не уступает, но и превосходит по функциональности коммерческие приложения. Приведу перечень основных бесплатных программ для статистической обработки данных.

(more…)

Читать дальше »

Во многих странах неотъемлемыми принципами работы онкологической службы являются систематическое исследование выявляемости и распространенности, точный учет исходов лечения на популяционном уровне, расчет выживаемости больных, применение биомедицинской статистики в целом. Именно поэтому существует большое число книг, монографий и публикаций по применению методов биомедицинской статистики в онкологии, которые, однако, могут быть обобщены на другие разделы медицины. Значительная часть хорошей методологической литературы по биомедицинской статистике находится в свободном доступе, о чем я уже писал ранее.

На сайте Международного агентства по исследованию рака под эгидой ВОЗ в свободном доступе представлена большая коллекция книг, монографий, сборников статей по изучению эпидемиологии, применению методов биомедицинской статистики, организации регистров больных, профилактике онкологических заболеваний. Перечислю лишь некоторые из них, которые можно рассматривать как универсальные пособия по изучению биомедицинской статистики для любой области медицины.

• Cancer Registration: Principles and Methods
• Cancer Epidemiology: Principles and Methods
• Cancer screening in the European Union (и в целом раздел по профилактике и онкологическому скринингу)
• Statistical Methods in Cancer Research. Volume IV – Descriptive Epidemiology
• Statistical Methods in Cancer Research. Volume I – The analysis of case-control studies
• Statistical Methods in Cancer Research – Volume II – The Design and Analysis of Cohort Studies
• Statistical Methods in Cancer Research – Volume III – The Design and Analysis of long-term animal experiments

Читать дальше »

Эпидемиология неинфекционных заболеваний является одной из наиболее динамично развивающихся областей в сфере медицинских наук и организации здравоохранения. В то же время, многим врачам и организаторам здравоохранения она практически незнакома, а в России выходит крайне мало как оригинальных статей, так и методических разъяснений по эпидемиологии неинфекционных заболеваний. В том числе поэтому крайне актуальным является знакомство с международным опытом проведения эпидемиологических исследований, методах их анализа и интерпретации. Ниже представлен перечень журналов по эпидемиологии неинфекционных заболеваний на английском языке, который включает как издания с бесплатным полнотекстовым доступом, так и распространяемые по подписке (с указанием сроков предоставления свободного доступа к полнотекстовым статьям).

(more…)

Читать дальше »

Расчет выживаемости больных на заместительной почечной терапии имеет определенные особенности по сравнению с расчетом выживаемости в общемедицинской практике. Это связано с тем, что в зависимости от анализируемого компонента выживаемости для одной и той же популяции пациентов могут различаться как события, которые рассматриваются как цензурированные случаи, так и срок наблюдения (подробнее о цензурированных случаях и конечных точках см. статью по общим принципам расчета выживаемости и летальности). Ниже приведен алгоритм и примеры расчета выживаемости больных на разных видах заместительной почечной терапии.
(more…)

Читать дальше »

В 2010 году Национальный институт здоровья США провел цикл лекций “Планирование и анализ небольших клинических исследований”, в которых раскрыты различные аспекты разработки дизайна, проведения и анализа клинических исследований. Хотя название цикла предполагает разбор небольших исследований, лекции изобилуют многочисленными примерами клинических исследований всех типов из всех областей медицины – от действительно небольших по числу пациентов, посвященных лечению редких (“орфанных”) заболеваний или злокачественных опухолей, до современных многотысячных исследований по кардиологии, пульмонологии, нефрологии.

Представленные лекции позволяют не только глубже изучить вопросы планирования небольших исследований (которыми, по сути, являются большинство проводимых в России исследований в рамках диссертационной работы), но и понять как определенный дизайн может повлиять на результаты клинического исследования, и почему популяция участвующих в исследованиях пациентов может весьма сильно отличаться от общей популяции пациентов с данным заболеванием.
(more…)

Читать дальше »

Одно из ведущих академических изданий National Academies Press открыло бесплатный полнотекстовый доступ ко всем выпущенным книгам (более 4000 книг), которые доступны для скачивания в формате pdf после простой регистрации. Среди широкого спектра тем имеется большой раздел по медицине.

Среди выпущенных книг представлены как узкоспециализированные, так и охватывающие универсальные для всей медицины темы издания. Ниже перечислена лишь малая часть доступных для прочтения книг с небольшими комментариями.

(more…)

Читать дальше »

По Руководство по работе в Medline можно скачать методическое пособие по работе в Медлайн через интерфейс Pubmed (сервер где изначально было размещено пособие закрылся, поэтому дублирую у себя: “ Руководство по работе в Medline“).

В методическом пособии наряду с основными данными о системе Medline (Pubmed) приведено описание поиска при помощи указателя предметных медицинских рубрик (MeSH), подбор термина по корню слова, возможности ограничения (фокусирования) поиска за счет логических операторов или имеющегося в Медлайн инструмента Limits.
Также описан поиск по фразам, автору, заглавию журнала, что позволяет находить в библиографической базе абстракт и ссылку на сайт журнала если Вы помните приблизительно где была опубликована статья и ключевые слова в заголовке или абстракте. Если Вы точно знаете исходящие данные нужной статьи, то Вы можете воспользоваться описанной авторами методички функцию Medline «Single Citation Matcher».
Подробно рассмотрены операции с результатами поиска – в каких форматах возможен просмотр и сохранение библиографических данных, пересылка их на электронную почту или подписка на свежие результаты поиска при помощи RSS.

Читать дальше »

Нашел в блоге медицинского статистика Сошникова видеоуроки Мичиганского университета о том как работать в программе SPSS.

Представлены практически все аспекты работы с SPSS – формирование таблиц с данными, сортировка, выборка, трансформация данных, работа с разными окнами SPSS, параметрические и непараметрические тесты, линейная и логистическая регрессии, кластерный и факторный анализы, анализ выживаемости (однофакторный Каплана-Майера и многофакторный Кокса), характеристическая кривая. Есть раздел по контролю качества данных на предмет выпадающих значений (которые подчас обусловлены неправильным вводом данных).

Немаловажно для начинающих, что к каждому видеоуроку можно скачать данные в формате SPSS, на основании которых он построен, и сравнить полученный результат с приведенным в ролике.

Все видеоуроки на английском.

Читать дальше »

Найденные в блоге доктора Topf прекрасные видеоруководства библиотеки клиники Мейо о том как работать в Медлайн (Medline, Pubmed). Это искусство – вместить столько в 12 минут.

PubMed Advanced Search: An Introduction

My NCBI-Custom Filters and Sharing Collections

Читать дальше »